黄色い謎の生物ミニオンの生きがいは、その時代の最強で最悪なボスの仲間になること。しかし、ボスたちの命は長続きしない。ミニオンたちの滅亡の危機が迫る1968年、3人のミニオンが仲間たちを救うべく立ち上がった。