高校生の美原アンは、札幌郊外の私立図書館でルールを破り、“物語の幻影”が彷徨する「図書迷宮」に迷い込む。迷宮の司書を務めることになったアンは、「図書館の本を多くの人間に読ませ、迷宮を復興する」よう命じられて…。